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New Approaches for the Generation and Analysis of Microbial Typing Data

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New Approaches for the Generation and Analysis of Microbial Typing Data als Buch

Produktdetails

Titel: New Approaches for the Generation and Analysis of Microbial Typing Data

ISBN: 044450740X
EAN: 9780444507402
Sprache: Englisch.
Herausgegeben von L. Dijkshoorn, K. J. Towner, Mark J. Struelens
ELSEVIER SCIENCE & TECHNOLOGY

Juli 2001 - gebunden - 370 Seiten

Beschreibung

The purpose of this book is to describe the best fingerprinting methods that are currently available and the computer-assisted strategies that can be used for analysis and exchange of data between laboratories. This book is dedicated to the memory of Jan Ursing (1926-2000), Swedish microbiologist, taxonomist and philosopher. "...taxonomy is on the borders of philosophy because we do not know the natural continuities and discontinuities..."

Inhaltsverzeichnis

Preface. List of contributors. 1. An introduction to the generation and analysis of microbial typing data (L. Dijkshoorn, K. Towner). 2. Theoretical aspects of pattern analysis (A. van Ooyen). 3. Setting-up intra- and inter-laboratory databases of electrophoretic profiles (H.F. Heersma, K. Kremer, D. van Soolingen, J. Hauman). 4. Fingerprinting of microorganisms by protein and lipopolysaccharide SDS-PAGE (L. Dijkshoorn). 5. rRNA gene restriction pattern determination (ribotyping) and computer interpretation (P.A.D. Grimont, F. Grimont). 6. Generation and analysis of RAPD fingerprinting profiles (K. Towner, H. Grundmann). 7. Analysis of microbial genomic macrorestriction patterns by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) typing (M.J. Struelens, R. De Ryck, A. Deplano). 8. Selective restriction fragment amplification by AFLP(tm) (P.J.D. Janssen). 9. Application and analysis of ARDRA patterns in bacterial identification, taxonomy and phylogeny (M. Vaneechoutte, M. Heyndrickx). 10. Insertion sequence (IS) typing and oligotyping (N.A. Saunders). 11. Molecular characterisation of microbial communities based on 16S rRNA sequence diversity (E.G. Zoetendal, A.D.L. Akkermans, W.M. de Vos). 12. From multilocus enzyme electrophoresis to multilocus sequence typing (D.A. Caugant). Author index. Keyword index.
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